本遊戲是《異域傳說》三部曲的完結篇，遊戲承襲 PS《異域神兵（Xenogears）》所建構的獨特世界觀。遊戲故事劇情接續在《異域傳說 二部曲》之後，敘述女主角 紫苑一行人將深入神秘生命體 格諾西斯 以及一切事件開端的 索哈爾 被後所隱藏的秘密之中。

本代的戰鬥系統繼承自《異域傳說 首部曲》以來的基礎，採取 3 人組隊的方式，各角色將依照敏捷度（AGI）來決定攻擊的頻率與順序，並顯示於行動順序表上。各角色除了體力（HP）與以太（EP，等同於一般 RPG 的 MP）計量表之外，並加入暫停（Break）與加速（Boost）計量表。暫停計量表在遭受敵人攻擊時會緩緩上升，超過上限時該角色將會強制停止行動兩回合；加速計量表則是透過攻擊敵人的方式累積，並可透過裝備提高上限值，每耗費 1 個加速值，可讓該角色無視於原本的行動順序，直接展開行動。藉由這兩個新系統的加入，來提升戰鬥的多樣性與刺激感。

攻擊的方式分為一般攻擊、技能、以太與必殺技。一般攻擊時，各角色將使用裝備的武器進行攻擊；技能是以消耗 EP 的方式所施展的特殊攻擊，分為暫停傷害類與物理傷害類，可給予敵人暫停計量表或 HP 的損傷；以太是消耗 EP 所施展的魔法，分為回復系、輔助系與攻擊系等 3 種；必殺技則是以消耗加速計量表的方式所施展的超強力攻擊，如以必殺技來結束戰鬥，將可獲得 1.5 倍的報酬