故事設定在 18 世紀中葉七年戰爭時期，《刺客教條：叛變》將為玩家在北美洲帶來更多可探索區域，包含北大西洋極地水域、阿帕拉契山脈荒野河谷以及紐約，跨足海上、陸上以及城市。在遊戲中，玩家將可運用全新武器、駕駛包含名為莫琳根號（The Morrigan）的船艦，航行在充滿機運的極地世界，包含衝撞冰原找出暗藏的地點、善用冰山作為海戰的掩護，抵禦會登艦並且佔領你的船艦與屠殺船員的刺客。

　　《刺客教條：叛變》以「質疑你的信念」作為主要訴求，透過全新角度切入這場介於刺客組織與聖殿騎士的千年戰爭，透過介於西元 1752 年至 1761 年間的故事來銜接《刺客教條 3》與《刺客教條 4：黑旗》的情節、串聯起一系列有關於美洲殖民時期的刺客傳奇篇章，包含海爾森、阿德瓦勒等前作角色也將在本作中登場。