本片根據DC最受歡迎跨界合作原著改編，蝙蝠俠與忍者龜之間的交鋒，絕對是高譚市前所未有的高潮迭起、血脈噴張的對決。

當高壇市的新敵人打算竊取新型實驗科技，蝙蝠俠進入全面備戰狀態。然而潛伏於黑暗中的一群戰士，也抱持相同目標。他們是忍者龜！

這群神秘的武術家包含隊長李奧納多，智囊多納太羅，熱血的拉斐爾，和滑稽的米開朗基羅，一現身便與黑暗騎士正面交鋒。