第三季的故事如今已告一段落，本季除了闡述正邪大戰的內容外，「下車生活」是否成為可能選項，也成為攸關故事走向的關鍵。

故事背景為，在上一季結局，本來合而為一的列車破雪號、大艾麗斯號，因男主角雷頓與反派威佛的交鋒而分離，如今雙方人馬的戰鬥也持續進行，最終雷頓暫時擊敗威佛，列車也再次結合。凱旋歸來的雷頓則給車上民眾畫了一個大餅—非洲某處有塊「新伊甸」氣候適宜人居，人類可離開列車展開新生活。這個願景雖有一定論據，卻也包含謊言色彩，最終也引發全新衝突。

火車成為人類生存的唯一地方，是《末日列車》的重要特色，破雪號、大艾麗斯號兩輛列車的分離所帶來的變化，便讓故事舞台有了新看點。兩列車分離時，破雪號的車廂遠少於大艾麗斯號，也對列車環境帶來影響，前者引擎供暖過剩，導致車廂宛如熱帶氣候，後者則供暖不足，以至於讓車廂宛如寒帶。環境的重大差異，也讓影集能透過強烈對比感營造趣味。