這是Wii上的首款《魔法老師涅吉》遊戲，玩家可以操縱涅吉和明日菜等學生在內的10人，並且其他學生也將作為人肉盾牌參與掩護。要想贏得戰鬥，就必須掌握住時機進行變身，對Wii手柄的操作將會直接影響到戰鬥的流暢性。而且遊戲支持最多4人同時作戰，涅吉飯們可以盡情享受合作或是對戰的樂趣。
本作最主要的模式就是故事模式與戰鬥模式兩大項。前者是可以讓玩家選擇遊戲角色來進行故事與戰鬥的模式（本作故事會依玩家角色不同而產生變化），至於戰鬥模式，則是可以讓玩家自由選擇角色跟地圖來對戰的模式。當對戰的時候，雙方最多合計共有4名角色會同時在3地圖上進行亂鬥，雖然玩家最多只能選擇10名角色中的其中一名來作為主要角色操作，但是卻可以從剩下的3-A學生22人中選擇兩名角色來擔任輔助角色，並透過這些輔助角色例如「HP回覆」、「能力上升」等不同的輔助支援能力組合來進行戰鬥。除此之外，遊戲中有時候還會有補充角色登場，這角色可能會給予玩家支援道具或是阻擾玩家，讓整個遊戲內容更加富有變化。
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