神曲奏界 THE BLACK》是以同名輕小說為基礎所改編的冒險類型作品，遊戲共分作 2 個章節，敘述成為神曲樂士的嬌小少女「瑪提亞」與跟她訂下契約的精靈「馬納伽」相遇之後所發生的故事。

　　本作第一章的時空背景約相當於「神曲奏界第 0 話」中尤奇利姊妹（ユギリ姉妹）來到學園參觀的數年前。

遊戲故事 

第一章 

　　新帝都行航空 231 號班機發生墜落事件，在這場事故中救出少女瑪提亞的，就是身材壯碩的精靈馬納伽。雖然瑪提亞因外科女醫師「蒂格蕾亞﹝ティグレア﹞」急救得當而保住性命，但瑪提亞的內心卻因受創而自我封閉，幸虧有馬納伽遲鈍卻純樸的對待，才讓她封閉的內心逐漸敞開。在那場意外過了半年，當瑪提亞得知自己將被送到設施後，馬納伽也作出了某個決定。
第二章
 
　　在那場墜機意外 3 年後，瑪提亞也與馬納伽一樣當上了警官，雖然瑪提亞少不更事，但冰雪聰明的她與馬納伽與馬納伽搭檔一起解決了重大案件，兩人因而被調任到精靈課。就在此時，在偶然的機會下他們遇到了街頭兒童潔莉卡﹝シェリカ﹞，當潔莉卡得知眼前兩人的刑警身份後，拼了命地拜託他們救救自己的父親……。