曾奪下日本唱片大賞的美聲歌姬平原綾香，這回戴上軍曹帽，變裝演唱電影主題曲，歌迷影迷耳福一次滿足！

這天，冬樹自愛莉莎處拿到了一個奇妙石像，這尊石像和軍曹長得一模一樣，打聽之下，得知是從以摩埃石像聞名的復活島上取得，這團未解的謎，誘使軍曹和冬樹兩人隱瞞大家案中展開一段冒險。即將抵達復活島之際，軍曹和冬樹突被不明生物攻擊而分散，在彼此尋找的過程中，陸續出現了不可思議的精靈瑪那，以及神秘的雙胞胎伊歐、拉那，島上深鎖的秘密與藍星迫在眉睫的危機，昭然若揭。而遠在日本的Keroro小隊同時間偵測到巨大能量反應，訊號正來自復活島。Keroro小隊立即前往搭救。一連串生死關卡接踵出現，眾人將遭遇史上最大的難關…，這座鬼魅幢幢的復活島，到底還藏匿多少祕密!?而傳說中的究極守護神，謎底即將揭曉…

除了美聲歌姬平原綾香，曾參加紅白歌唱大賽而一炮而紅的新生代女子團體AKB48，更派出了小師妹「SKE48」中三位美少女松下唯、向田茉夏、矢神久美，獻出電影配音秀。「KERORO軍曹 Girl’s」特別版啦啦隊即由三人組成，她們於電影宣傳造勢期間，飽了眾多觀眾眼福。